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MOE 2010.10用 SVLプログラム集
ご利用方法
このページは、弊社が開発したSVLプログラム及び、CCG社から報告された修正ファイルを掲載しています。インストール方法・ダウンロード方法については、各ページをご参照ください。掲載されているプログラムは無償でご利用いただけますが、著作権は（株）菱化システムに帰属します。なお万が一、これらのプログラムによりマシン等の不具合が発生しても責任は負いかねますので、予めご了承ください。
MOE2010.10用のプログラム
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パッチファイル
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| MOE/web パッチファイル |
MOE 2010.10 MOE/web カスタムアプリケーションの日本語説明文に対応したプログラム、Windows用 MOE/web自動起動設定ツールの修正、MOE/web抗体モデリングアプリケーションの修正 |
| 圧縮配座データの展開機能 パッチファイル |
MOE 2010.10 圧縮配座データベースファイル展開機能の不具合の修正 |
| ファイル保存関数 パッチファイル |
MOE 2010.10 ファイル保存 SaveAs関数の不具合の修正 |
| データベースインポート機能 パッチファイル |
MOE 2010.10 データベースインポート機能の元ファイル名を記録するオプションの不具合の修正 |
| MOE Extensions for KNIME パッチファイル |
MOE Extensions for KNIME 2.0.2 一部ノードにおける不具合の修正 |
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分子構築・表示ツール
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| Rainbow Color Ribbon | タンパク質のリボンを虹色で表示するプログラム (2006.9.6作成) |
| Exhibition | 分子の回転、リボンの逐次描画、スライスなど、自動的に表示を動かすプログラム (2003.9.30作成) (2007.4.4更新) |
| Subset Manager | 原子を任意にグループ化し、 グループ毎に、Hide / Show, Select /
Unselect, Activate / Inactivateを切り替えるためのプログラム (2004.1.15更新) |
| Molecule Object Manager | 複数の分子鎖について、分子鎖ごとのHide / Show, Select / Unselect,
Activate / Inactivateを切り替えるためのプログラム (2002.10.13作成) (2004.7.8更新) |
| pseudorestrain | 選択された複数の原子を代表する pseudoatomを定義し、各原子との間に距離拘束を掛ける機能 (2002.8.6作成) |
| Substructure Superposition | 複数の分子について共通部分構造を基準に重ね合わせを行うプログラム (2002.12.1作成) (2010.8.5更新) |
| 静電ポテンシャル計算ツール | Poisson-Boltzmann方程式により空間の静電ポテンシャルを計算するプログラム (2010.12.21作成) |
| 体積差分計算ツール | 分子構造や結合サイトの体積の差分および和集合、積集合を算出・表示するプログラム (2010.10.27作成) |
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QSAR・ライブラリ解析
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| AutoGPA |
3D-QSARモデル自動構築ツール (2010.07.15作成) (2011.4.26更新) NEW |
| AutoQuaSAR |
QSAR解析自動化インターフェイス (2005.01.17作成) (2005.01.24改訂) (2006.06.30改訂) (2006.12.19改訂) (2007.03.05改訂) (2007.11.12改訂) |
| QuaSAR-Evolution |
遺伝的アルゴリズムを用いた記述子の自動選択 (2001.12.27作成) (2004.10.1改訂) (2005.3.7改訂) (2006.2.22改訂) (2006.06.12改訂) (2007.03.05改訂) (2010.02.13改訂) (2010.11.29改訂) |
| PSA記述子 | Polar Surface Areaを計算するi3D 記述子 (2001.3.12作成) (2005.10.3改訂) |
| Binary QSAR結果解析ツール | BinaryQSARモデルによる判別結果を解析するためのEnrichment
plot図を出力するプログラム (2002.8.7作成) |
| Druglikeness Rule Fingerprint Filter | MOEの2D記述子を用いて活性分子のもつ特性を捉えたスクリーニングを行うためのプログラム (2009.4.30作成) (2010.01.12改訂) |
| K-Means Cluster | K-Meansアルゴリズムによるクラスタリング (2006.1.26作成) (2006.7.03 改訂) (2006.12.01 改訂) (2010.12.24 改訂) |
| Scaffold Search | 分子群から共通部分構造を探索するプログラム (2007.7.27作成) |
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ドッキングシミュレーション
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| ASEDock |
受容体ポケットの形状を簡略化した独自のASEモデルに基づく高速ドッキングプログラム (2004.11.12 β版作成) (2004.12.27 正式版作成) (2005. 8.11 2005版作成) (2010. 4. 2 MOE 2009.10対応版作成) (2010. 5.10 改訂) MOE 2009.10対応版以降のASEDockはMOE 2010.10にも対応しています |
| ドッキングスコア算出ツール | ドッキング計算の結果やInduced-Fitオプションによるホモロジーモデルに対して各種ドッキングスコアと相互作用エネルギーを算出するプログラム (2011.06.27作成) NEW |
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データベースツール
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| corr_tbl.svl | Correlation MatrixをMDBファイルに書き出す機能 (2001.7.24作成) |
| MOE-MolFilter.svl |
分子構造を指定したルールに従って判別するプログラム |
| 配座クラスタリング | ドッキングや配座解析から得られるコンフォメーションをRMSDを基準にクラスタリングするプログラム (2001.8.24作成) (2003.8.26改訂) (2005.2.9改訂) (2008.2.14改訂) (2008.11.12改訂) (2010.7.14改訂) |
MOE-Form Browser | MDBファイルのデータを帳票表示、検索するプログラム (2006.9.1作成) (2010.3.26改訂) (2010.6.17改訂) |
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MOE/webアプリケーション
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| MOE/web 追加アプリケーション群 | MOE/web用アプリケーション(配座解析、低分子重ね合わせ、SDファイル対応物性/記述子計算)を追加するファイルセット (2011.2.8作成) |
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インターフェース
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| MOE Extensions for KNIME | KNIME 上からMOEの解析ノードを利用するためのインターフェース (2009.8.3作成) (2010.12.17改訂) (2011.7.20改訂) (2011.10.5 改訂) |
| POV-Ray Extended Interface | 様々な効果を付加できるPOV-Rayインターフェース (2009.4.1作成) (2011.5.26改訂) |
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SVLプログラミング
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| source_file.svl | 関数名、QuaSAR記述子名などからSVLソースファイルを検索し、表示する (2005.8.19作成) (2007.4.16改訂 (2009.10.6改訂 (2010.12.22改訂) |
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