Partek Expressは、遺伝子発現解析に必要な機能だけで構成されたデータ解析初心者向けパッケージソフトウェアです。Affymetrix社のGeneChipやIllumina社のBeadArray、Agilent Technologies社、NimbleGen社のアレイのデータ解析をサポートします。 操作方法は非常にシンプルです。ソフトウェアからの質問に順番に回答するだけで、測定データのインポートから発現量に変動のある遺伝子を抽出までを行えます。2群比較から複雑な研究デザインのデータセットまで様々な実験条件で利用できます。 QCチェック機能も搭載しているので問題のあるサンプルの検出も可能です。プローブのアノテーション機能や解析結果を学会や論文発表で使用するための作図機能も搭載しています。

シンプルなインターフェース

• 画面の指示に従って必要な情報を順次入力するだけでデータ解析が可能
• 結果はステップごとにグラフと表形式で出力
• 設定内容はレポート形式で出力

QCチェック

• コントロールプローブから外れ値を示すサンプルを検出
• 主成分分析を用いたサンプル間のばらつきを判定
• 検定力分析により実験に必要なサンプル数または閾値を判定

データ解析機能

• 2群または3群以上の比較検定
• 遺伝子の発現変化に影響を与える表現型の特定
• サンプル数と検出力の判定

アノテーション、生物学的解釈機能

• 各プローブに対応する遺伝子のアノテーション情報を取得
• Ariadne Pathway Studio Exploreがインストールされているマシンの場合はパスウェイ解析が可能
  ※Ariadne Pathway Studio Exploreは別途購入してください

作図機能

• QC結果、サンプルの主成分分析、効果量、遺伝子の発現量をグラフ表示
  色、形、大きさが変更可能
• 表示した画像をイメージファイル(JPEG, GIF, PNG, TIFF, SVG形式)として保存
  プレゼンテーション用の図として利用可能

その他の特長

• 一連のデータ解析に使用したデータと解析アルゴリズムをリファレンス情報を付けてレポート
• 解析に使用した一連のデータをZIP形式の圧縮ファイルとしてアーカイブ

Partek Expressは、Affymetrix社のGeneChip、Illumina社のBeadArray、Agilent Technologies社とNimbleGen社のDNAチップに対応しています。

	Affymetrix GeneChip
	・	Gene Expression

	illuminaBeadArray
	・	Gene Expression

	Agilent Technologies社 DNA Microarrays
	・	Gene Expression

	NimbleGen社 マイクロアレイ
	・	Gene Expression