三菱ケミカルホールディングスグループ
  • 生命科学系分子科学計算ソフトウェア
  • 材料科学系分子科学計算ソフトウェア
  • 化学工学系ソフトウェア
  • 技術計算プットフォーム
  • データ管理・解析システム
  • Home > 
  • 製品情報 > 
  • Partek > 
  • 発現解析アレイデータ解析ソフトウェア Partek Express

ゲノムデータ解析ソフトウェア Partek

発現解析アレイデータ解析ソフトウェア Partek Express


Partek Express

簡単な操作で発現解析を実行可能

Partek Expressは、遺伝子発現解析に必要な機能だけで構成されたデータ解析初心者向けソフトウェアです。アフィメトリクス社のGeneChipやイルミナ社のBeadArray、アジレント・テクノロジー社、ロシュ・ダイアグノスティックス社のマイクロアレイのデータ解析をサポートします。 操作方法は非常にシンプルです。表示される設定画面に順番に入力するだけで、測定データのインポートから発現量に変動のある遺伝子を抽出まで一連の操作を行えます。2群比較から複雑な実験条件のデータセットまで様々な実験条件で利用できます。 クオリティコントロール機能や検出力分析機能を搭載しているので、問題のあるサンプルを取り除いたり解析に必要なサンプル数を推算することも可能です。プローブのアノテーション機能や解析結果を学会や論文発表で使用するための作図機能も搭載しています。

特長

シンプルなインターフェース
  • 画面の指示に従って必要な情報を順次入力するだけでデータ解析が可能
  • 結果はステップごとにグラフと表形式で出力
  • 設定内容はレポート形式で出力
クオリティコントロール機能
  • コントロールプローブから外れ値を示すサンプルを検出
  • 主成分分析を用いたサンプル間のばらつきを判定
  • 検定力分析により実験に必要なサンプル数または閾値を判定
データ解析機能
  • 2群または3群以上の比較検定
  • 複数の実験条件での比較解析
  • サンプル数と検出力の判定
アノテーション、生物学的解釈機能
  • 各プローブに対応する遺伝子のアノテーション情報を取得
  • Ingenuity IPAまたはElsevier Pathway Studioがインストールされているマシンの場合はパスウェイ解析が可能
    ※Ingenuity IPAまたはElsevier Pathway Studioは別途購入する必要があります。
作図機能
  • QC結果、サンプルの主成分分析、効果量、遺伝子の発現量をグラフ表示
    色、形、大きさが変更可能
  • 表示した画像をイメージファイル(JPEG, GIF, PNG, TIFF, SVG形式)として保存
    プレゼンテーション用の図として利用可能
その他の特長
  • 一連のデータ解析に使用したデータと解析アルゴリズムをリファレンス情報を付けてレポート
  • 解析に使用した一連のデータをZIP形式の圧縮ファイルとしてアーカイブ

マイクロアレイの対応状況

Partek Expressは、アフィメトリクス社のGeneChip、イルミナ社のBeadArray、アジレント・テクノロジー社とロシュ・ダイアグノスティックス社のマイクロアレイに対応しています。

アフィメトリクス GeneChip
Gene Expression
イルミナ BeadArray
Gene Expression
アジレント・テクノロジー マイクロアレイ
Gene Expression
ロシュ・ダイアグノスティックス マイクロアレイ(2012年末販売終了)
Gene Expression


関連製品

GENEVESTIGATOR
遺伝子発現データベース
Mathematica
技術計算プログラム開発環境

このページのトップへ