計算プログラムを使用すると膨大なデータが出力されますので、その効率的・効果的な解析が必要になります。SciMAPSには、膨大なデータのグラフ化や可視化のための機能が搭載されています。量子化学・量子物理計算、および分子力学・動力学計算から出力されるデータに対して、以下のような解析を行うことができます。